飞仙关镇中心卫生院是一所集医疗、预防、保健为一体的综合性公立医院，占地面积4533.75平方米，建筑面积1780平方米。现有职工17人，专业技术人员17人（中级技术职称2人、初级技术职称15人）。
开设门诊部和住院部，开放床位20张，主要有半自动生化分析仪、200MAX光机、B超机、心电监护仪、麻醉剂、血球分析仪等医疗设备，分管辖区内4所村卫生室及4名村卫生室人员。主要开展普通医疗服务，内科、中医科、儿科、公共卫生科等，其中中医科是该院特色科室。
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